Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3C3Q8NEB9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms