Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATG16L2Q8NAA4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms