Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00612Q8N6U2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms