Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXP4Q8IVH2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXP4Q8IVH2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms