Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms