Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms