Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBR1LQ6UX01 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMBR1LQ6UX01 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms