Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SUSD1Q6UWL2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms