Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms