Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms