Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF123Q5XPI4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms