Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BROXQ5VW32 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BROXQ5VW32 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms