Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GKAP1Q5VSY0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms