Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms