Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms