Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms