Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP41Q3LFD5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP41Q3LFD5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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