Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms