Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PFKFB3Q16875 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms