Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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