Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDB1Q16531 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDB1Q16531 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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