Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms