Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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