Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCLAFQ15004 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms