Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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