Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms