Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A3Q14050 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A3Q14050 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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