Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNGB1Q14028 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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