Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1CQ13936 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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