Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR4Q13639 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms