Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1orf61Q13536 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms