Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF4BQ13523 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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