Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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