Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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