Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MKRN3Q13064 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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