Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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