Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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