Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms