Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNG1Q06432 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNG1Q06432 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms