Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIP4K2BP78356 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIP4K2BP78356 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms