Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P63132 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms