Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UFM1P61960 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UFM1P61960 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFM1P61960 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFM1P61960 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFM1P61960 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFM1P61960 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFM1P61960 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFM1P61960 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms