Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRKAA2P54646 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms