Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP2P53365 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms