Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms