Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSK3BP49841 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSK3BP49841 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms