Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCT3P49368 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCT3P49368 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms