Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms