Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MAP2K4P45985 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MAP2K4P45985 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms