Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SOX11P35716 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX11P35716 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX11P35716 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX11P35716 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX11P35716 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX11P35716 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX11P35716 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms